Le musée est organisé autour de quatre univers thématiques :
– l’Espace Victorien, principalement consacré à l’histoire de Londres et aux Jardins de Kensington, mais aussi à des articles sur l’univers étendu de Peter Pan
– l’Espace Barrie, intégralement dédié au créateur de Peter Pan, à la vie de l’homme et à son œuvre
– l’Espace Neverland, destiné à la mythologie du Pays de Jamais-Jamais, à ses paysages, à ses habitants, à sa faune et à sa flore
– l’Espace Pan, reservé aux productions et aux créations artistiques liées à l’univers de Peter Pan (films, spectacles, livres, attractions et bien plus encore)